Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms