Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms