Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms