Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cspp1B2RX88 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms