Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah3B2RWG3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms