Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn8B1ARD8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms