Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms