Protein–RNA interactions for Protein: A2BDP1

Fam155b, Transmembrane protein FAM155B, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam155bA2BDP1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam155bA2BDP1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam155bA2BDP1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms