Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms