Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Kiaa1109A2AAE1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kiaa1109A2AAE1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms