Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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