Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms