Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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