Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uso1Q9Z1Z0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uso1Q9Z1Z0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms