Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms