Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms