Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms