Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn3Q9Z0G9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn3Q9Z0G9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn3Q9Z0G9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn3Q9Z0G9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn3Q9Z0G9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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