Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacsin2Q9WVE8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms