Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnn1gQ9WU39 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnn1gQ9WU39 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms