Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp18Q9WTV6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp18Q9WTV6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp18Q9WTV6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp18Q9WTV6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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