Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms