Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms