Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms