Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms