Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Col5a3Q9JLI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Col5a3Q9JLI2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms