Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms