Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms