Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms