Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Mrpl39Q9JKF7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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