Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mlh1Q9JK91 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms