Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms