Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spag4Q9JJF2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spag4Q9JJF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms