Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RprmQ9JJ72 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RprmQ9JJ72 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms