Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pgpep1Q9ESW8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms