Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtm7Q9ESD6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms