Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms