Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms