Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snap29Q9ERB0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms