Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn2Q9ER65 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms