Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms