Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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