Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde1Q9DBZ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms