Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms