Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhobtb1Q9DAK3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb1Q9DAK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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