Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms