Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2e2Q9D902 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms