Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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