Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms