Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RtcAQ9D7H3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RtcAQ9D7H3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms